De zoektocht van pianist naar authenticiteit leidde tot een consequente specialisatie: het vertolken van de klassieke, romantische en impressionistische pianoliteratuur op originele instrumenten.
Hiernaast is Vermeulen eveneens een fervent vertolker van hedendaagse muziek.

Jan Vermeulen wordt beschouwd als een zeer invloedrijke artiest in zijn vakgebied. Na zijn pianostudies aan het conservatorium te Brussel duwt zijn drang naar authenticiteit hem al snel in de richting van de historische instrumenten. Zijn grensverleggende opname van de sonates van C.M. von Weber betekende in het begin van de negentiger jaren de start van een bloeiende loopbaan als fortepianist.
In dezelfde periode richt hij het Fortepianotrio Florestan op. Het ensemble (later omgedoopt tot Tröndlin Trio) was één van de eerste dat naast het klassieke ook het romantische repertoire vertolkte op authentieke instrumenten.

Jan Vermeulen kan terugblikken op een indrukwekkende discografie van meer dan dertig titels. Zo oogst hij wereldwijde faam met de integrale opname van Schuberts klavierwerk voor het Nederlandse Et’cetera, een magnum opus dat hij in 2010 voltooide.

Naar aanleiding van dit project werd hij in hetzelfde jaar verkozen tot ‘Musicus van het jaar’. In tal van internationale vakbladen wordt hij ‘de ideale Schubert-vertolker’ genoemd en gelden zijn interpretaties als de nieuwe referentie.
Ook zijn laatste dubbel-CD met werk van Robert Schumann wordt  internationaal alom geprezen en onthaald als één van de belangrijkste bijdragen tot het Schumannjaar 2010.

Als solist is hij te gast in tal van Europese landen. Zijn voorliefde voor de kamermuziek brengt hem samen met musici als Wieland Kuijken, Paul Dombrecht, Christine Busch, Roel Dieltiens, Marcel Ponseele, de ensembles Explorations en Il Gardellino en tal van vocale artiesten.
Sinds 2010 vormt hij een hecht duo met  de celliste France Springuel. Samen starten ze in 2011 een concert- en CD-project met de integrale werken voor cello en pianoforte van Beethoven, Schumann, Brahms e.a.

Naast zijn loopbaan als vertolker is Jan Vermeulen ook een gedreven pedagoog. Hij doceert piano, fortepiano en kamermuziek aan het Lemmensinstituut te Leuven.