Stefaan Craeynest behaalde aan het Conservatorium van Gent eerste prijzen voor cello en kamermuziek. Zijn studies in de klas van André Messens werden bekroond met het Hoger Diploma met onderscheiding voor cello. In de klas van Marcel Lequeux behaalde hij het Hoger Diploma met grote onderscheiding voor kamermuziek. In 2000 werden zijn studies bekroond met de Meestergraad cello aan het Lemmensinstrituut te Leuven.

Naast zijn werk als aanvoerder cello bij het Collegium Instrumentale Brugense en daarna Het Kamerorkest, was hij oprichter van het kamermuziekensemble Arco Baleno. Hiermee behaalde hij de debuutprijs voor kamermuziek van Jeugd en Muziek Vlaanderen en werd hij laureaat van het internationale CHAIN-concours.
Met het toenmalig Collegium Instrumentale werkte hij mee aan tientallen opnames. Ook met Arco Baleno nam hij 17 cd’s op. Op de laatste cd, die twee dagen voor zijn overlijden is uitgebracht, vertolkt hij het cello-concerto in C van Antonio Vivaldi.
Als docent was Stefaan verbonden aan het stedelijk conservatorium te Oostende en de muziekacademies van Diksmuide, Poperinge en Blankenberge.

Stefaan was medeoprichter en bezieler van Esta Belgium-Flanders, een vereniging die zich inzet voor het onderwijs aan strijkers. Stefaan schreef artikels, ging op congres, organiseerde masterclasses en was financieel beheerder.